
・ストーリー :ストーリーを楽しむ事が出来ます。
・チャレンジ :様々なパズルにチャレンジする事が出来ます。
・デザイン :自分だけのパズル画面をデザイン出来ます。
・オプション :絵をみたり、声を聞けたり、各種設定が出来ます。
・タイトルへ戻る:タイトル画面に戻ります。

「乱太郎」、「きり丸」、「しんべヱ」となって
忍術学園で繰り広げられる「学年対抗戦」のお話を楽しむことが出来ます。
課題を決まった数クリアーすることで、各学年に勝ったことになります。
課題をこなせなかった時は負けたことになります。
全学年と戦った結果に応じてエンディングが決定します。

「チャレンジモード」では様々なパズルにチャレンジする事が出来ます。
▲先生にチャレンジ
忍術学園の先生方から出される課題にチャレンジします。
土井先生のお話に従って、どの先生のチャレンジを受けるか選んで下さい。
コースは全部で3つです。
・土井先生コース:比較的簡単な課題チャレンジです。
・山田先生コース:ちょっと難しい課題チャレンジです。
・戸部先生コース:手強い課題チャレンジです。
▲ひとりでチャレンジ
ひたすらパネルを消し、ハイスコアを目指します。
スコアはランキング表に記載され、過去上位5つ分のスコアを一覧できます。
土井先生のお話に従って、キャラクターを選ぶとスタートとなります。
▲みんなにチャレンジ
忍たま同士で課題にチャレンジすることが出来ます。
土井先生のお話に従って、キャラクターを選ぶとスタートとなります。
対戦相手は二年から六年、くノ一までの忍たまを選ぶことが出来ます。
自分が操る忍たまは一年~六年、くノ一から選んで下さい。

「忍たまポイント」はストーリーモードで課題をクリアーしていくことで得られるポイントです。
忍たまポイントを使ってデザインモードでパズル画面のデザインを変更することができます。
手に入れた「忍たまポイント」を使って、自分だけのパズル画面のデザインが出来ます。
デザインで変更できるのは「パネル」「カーソル」「フィールドの枠」です。